Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNN3Q15417 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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