Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ACAP1Q15027 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ACAP1Q15027 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACAP1Q15027 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACAP1Q15027 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACAP1Q15027 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACAP1Q15027 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.5 ms