Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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