Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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COL9A2Q14055 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A2Q14055 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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