Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PDE3BQ13370 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDE3BQ13370 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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