Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRAP18433 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRAP18433 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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