Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
PKHD1P08F94 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PKHD1P08F94 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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