Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN3O15551 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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CLDN3O15551 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN3O15551 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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