Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TM6SF1Q9BZW5 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TM6SF1Q9BZW5 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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