Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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USP49Q70CQ1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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USP49Q70CQ1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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USP49Q70CQ1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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USP49Q70CQ1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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USP49Q70CQ1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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USP49Q70CQ1 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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