Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DDB1Q16531 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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