Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
RIPK1Q13546 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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