Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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