Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IFITM3Q01628 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms