Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX13Q9Y5W8 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms