Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SGCAQ16586 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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SGCAQ16586 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SGCAQ16586 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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