Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KARSQ15046 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KARSQ15046 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KARSQ15046 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KARSQ15046 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KARSQ15046 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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