Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNFAIP1Q13829 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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