Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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RIPK1Q13546 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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RIPK1Q13546 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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RIPK1Q13546 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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RIPK1Q13546 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIPK1Q13546 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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