Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP35Q9P2H5 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP35Q9P2H5 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP35Q9P2H5 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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