Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CCDC74AQ96AQ1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC74AQ96AQ1 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC74AQ96AQ1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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