Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SKIDA1Q1XH10 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.4 ms