Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCBQ16585 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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