Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SCARB2Q14108 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SCARB2Q14108 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCARB2Q14108 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCARB2Q14108 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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