Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX13Q9Y5W8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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