Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SEC23BQ15437 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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SEC23BQ15437 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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SEC23BQ15437 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SEC23BQ15437 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SEC23BQ15437 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEC23BQ15437 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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