Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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