Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNGB1Q14028 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CNGB1Q14028 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNGB1Q14028 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGB1Q14028 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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