Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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