Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK3Q13003 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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