Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc8Q9CYA6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zcchc8Q9CYA6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms