Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif3aP28741 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms