Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1Q9UJ41 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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