Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CNN3Q15417 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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