Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
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ATRQ13535 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
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