Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.9 ms