Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NRXN3Q9Y4C0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NRXN3Q9Y4C0 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NRXN3Q9Y4C0 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms