Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CNN3Q15417 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.2 ms