Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A2Q14055 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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