Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SQSTM1Q13501 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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