Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271 ms