Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRGP23470 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRGP23470 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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