Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRAP18433 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRAP18433 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.5 ms