Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKHD1P08F94 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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