Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TTF1Q15361 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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