Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TNFAIP1Q13829 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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TNFAIP1Q13829 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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TNFAIP1Q13829 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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