Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SQSTM1Q13501 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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