Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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