Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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DDB1Q16531 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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DDB1Q16531 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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DDB1Q16531 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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DDB1Q16531 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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DDB1Q16531 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDB1Q16531 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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