Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX17Q15036 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX17Q15036 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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